「国立ハンセン病療養所に29のキリスト教会があり、大別してプロテスタント教会（17）とカトリック教会（12）があります。プロテスタントは、日本キリスト教団(3)、日本聖公会(6)、日本新生キリスト教会(1)、キリストの教会(1)、単立教会(6)に分かれています。

現在の会員数、礼拝出席数は2023年10月末の調査に基づきますが、実態が不明の場合は記載していません。なお、各療養所教会の具体的な状況一覧については、下記の「療養所教会状況」をご覧ください。

（注）文中の「長島聖書学舎」とは、1961年（昭和36）長島愛生園内に開校された３年制の聖書学校のことです。閉校となる1971年（昭和46）までの10年間に、20名の卒業生を送り出しました。卒業生は療養所教会の牧師、あるいは社会復帰して伝道者として働きに従事しました。好善社は学舎運営の財政面を担いました。